Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VN1R3Q9BXE9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms