Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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