Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC120Q96HB5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms