Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms