Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNFT2Q96EX2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms