Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RSPRY1Q96DX4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms