Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms