Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms