Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms