Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms