Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF1Q8N6C5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms