Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RYBPQ8N488 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms