Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H3Q8IVL6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms