Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALYREFQ86V81 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms