Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms