Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFYVE16Q7Z3T8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms