Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRCQ7RTU9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms