Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP31Q70CQ4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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