Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms