Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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