Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRAMD4Q6IC98 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRAMD4Q6IC98 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms