Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms