Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALFQ53S48 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms