Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms