Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms