Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00303Q3SY05 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms