Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms