Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL40Q2TBA0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms