Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC27Q2M243 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms