Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms