Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDO1Q16878 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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