Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPROQ16827 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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