Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FSCN1Q16658 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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