Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms