Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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