Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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