Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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