Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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