Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA2Q15822 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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