Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNHIT3Q15649 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms