Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF1AQ15573 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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