Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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