Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIDRQ14159 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms