Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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