Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOFQ13790 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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