Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL4BQ13620 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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