Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTK7Q13308 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTK7Q13308 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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