Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENBP1Q13228 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms