Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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