Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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